В не столь отдаленном будущем люди узнали о существовании мутантов и очень не рады вынужденному соседству с ними. Сверх-силы мутантов пугают людей, и они пытаются оградить себя от общения с ними, но проблема в том, что определить мутации в большинстве случаев можно только в период полового созревания. Социальная напряженность растет, и некоторые мутанты отвечают людям взаимной неприязнью.
Группа сверх-людей под предводительством загадочного Магнето стремится захватить власть и планирует нападение на человечество. Когда-то он был другом профессора Чарльза Ксавьера – могущественного телепата, прикованного к инвалидному креслу. Но поскольку Ксавьер всегда стремился к сохранению мира между людьми и мутантами, их пути разошлись. Теперь Чарльз управляет школой мутантов, и ему помогают Джин Грей, владеющая телепатией и телекинезом, Скотт Саммерс, генерирующий лазерные лучи, и другие мутанты. После того как к ним присоединяются нелюдимый Логан и печальная девушка Мари, начинается война между Ксавьером и Магнето.
